单细胞与空间转录组分析研究进展

许醒; 蔡林峰; 张倩楠; 杨启正; 梁珊珊; 李铭殷; 李翀; 杨朝勇

doi:10.19969/j.fxcsxb.22052401

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单细胞与空间转录组分析研究进展

综述 | 更新时间：2023-01-04

- 单细胞与空间转录组分析研究进展
- Progress on Single-cell and Spatial Transcriptome Analysis
- 分析测试学报 2022年41卷第9期页码：1322-1334
- 作者机构：
  
  1.厦门大学化学化工学院，福建厦门 361005
  2.上海交通大学分子医学研究院，上海 200217
- 作者简介：
  
  杨朝勇，博士，教授，研究方向：生物分析化学，核酸化学生物学，E - mail：cyyang@xmu.edu.cn
- 基金信息：
  
  国家自然科学基金资助项目(21927806;21735004;21521004;21325522;21904085)
- DOI：10.19969/j.fxcsxb.22052401
  中图分类号：
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许醒,蔡林峰,张倩楠等.单细胞与空间转录组分析研究进展[J].分析测试学报,2022,41(09):1322-1334.

XU Xing,CAI Lin-feng,ZHANG Qian-nan,et al.Progress on Single-cell and Spatial Transcriptome Analysis[J].Journal of Instrumental Analysis,2022,41(09):1322-1334.
许醒,蔡林峰,张倩楠等.单细胞与空间转录组分析研究进展[J].分析测试学报,2022,41(09):1322-1334. DOI： 10.19969/j.fxcsxb.22052401.

XU Xing,CAI Lin-feng,ZHANG Qian-nan,et al.Progress on Single-cell and Spatial Transcriptome Analysis[J].Journal of Instrumental Analysis,2022,41(09):1322-1334. DOI： 10.19969/j.fxcsxb.22052401.

摘要

单细胞的异质性在胚胎发育、神经系统发育、癌症病变等生物学过程中具有重要的研究意义。单细胞转录组测序利用测序技术解析细胞内转录本序列，为细胞异质性研究提供可靠、准确的研究手段及观测视野，为揭示生物发育规律、疾病发生发展机制等提供了重要的技术手段。该文围绕单细胞与空间组学分析，综述了近年来发展的各类单细胞转录组测序、单细胞多组学测序及空间转录组分析方法，分析了其优缺点。同时展望了单细胞与空间转录组分析领域的发展趋势，即开发低成本、全方位、高通量、高分辨的单细胞空间多组学分析方法以实现对单个细胞更为细致、全面及准确的描述和精准单细胞图谱构建。

Abstract

Heterogeneity in single cells has important implications for embryo development，neurogenesis and cancer progress．Single-cell transcriptome sequencing，decoding transcript sequences within cells based on high-throughput sequencing technology，can provide reliable and accurate research methods for cellular heterogeneity study to reveal the rule of biological development and disease progress．Different methods for single-cell transcriptome sequencing，single-cell multi-omics sequencing and spatial transcriptome analysis in recent years are summarized in this review．Challenges and perspectives of single-cell and spatial transcriptome analysis are discussed．Low-cost，all-round，high-throughput，high-resolution single-cell spatially multi-omics analysis is helpful to construct comprehensive and accurate single-cell atlas.

关键词

单细胞测序转录组多组学空间转录组研究进展

Keywords

single-cell sequencingtranscriptomemulti-omicsspatial transcriptomeresearch progress

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