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1. 上海交通大学系统生物医学研究院
2. 浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院
Published:2009
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[J]. 2009, (2): 129-134.
DOI:
[J]. 2009, (2): 129-134. DOI:
从正常培养的IGROV-1/CP细胞中提取小RNA
构建小RNA的cDNA文库
然后用illum ina通用测序平台对上述cDNA文库进行测序。从测序获得的序列数据中去除冗余数据后
与已知人类m iRNA序列数据库进行比对
获得IGROV-1/CP细胞m iRNA表达谱。以所获的序列长度与已知人类m iRNA数据库中序列长度差异不大于2和无碱基错配为限制条件
共找到53种已知m iRNA。按在cDNA文库测序中的出现频率计算
出现频率不大于10的低拷贝m iRNA最多
占检测到所有m iRNA种类的56.6%。说明illum ina通用测序技术能够在检测细胞内的各种小RNA序列的同时反应相对丰度信息
该研究利用上述新技术获得了顺铂耐药性IGROV-1/CP细胞系m iRNA表达种类和相对丰度的实验数据。
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