Estudio de la detección de microRNA-31 en saliva mediante reacción de amplificación isotérmica por desplazamiento de cadena / sistema CRISPR-Cas12a combinado con tira de prueba de realce fluorescente inverso
Se construyó un método para la detección amplificada en colaboración basado en la reacción de amplificación isotérmica de desplazamiento de cadena de ácido nucleico (ISDA) y el sistema CRISPR-Cas12a para detectar microRNA-31 (miRNA-31), utilizando una tira de prueba de realce fluorescente inverso (rLFTS) como plataforma de señal para lograr detección visual. Mediante la optimización del diseño de cebadores de la reacción ISDA y del tampón de reacción, se logró el reconocimiento específico de miRNA-31 y la primera amplificación de señal, generando un producto de ADN de doble cadena que activa la actividad de corte trans transcrítica de CRISPR-Cas12a sobre moléculas reporteras de ADN de cadena simple (ssDNA) libres, mientras que inhibe la formación de una estructura tipo sándwich entre las sondas de oro nano y la sonda fluorescente Cy5 en la línea de detección, restaurando así la fluorescencia Cy5, utilizándose esto como señal cuantitativa para una detección altamente sensible y específica de miRNA-31. El límite de detección en muestras de saliva es tan bajo como 57.9 amol/L, con una tasa de recuperación del 91.6 % al 111 %, y los resultados de la detección muestran buena concordancia con los resultados cuantitativos de la reacción en cadena de la transcriptasa inversa cuantitativa (qRT-PCR), con un tiempo de detección de solo 90 minutos. Los resultados experimentales demuestran que el método tiene ventajas de operación simple, alta sensibilidad y tiempo de detección corto, satisfaciendo la necesidad de detección ultrasensible de miRNA-31 en muestras de saliva.
关键词
Amplificación isotérmica por desplazamiento de cadena;CRISPR-Cas12a;Tira de prueba de realce fluorescente inverso;MiRNA-31;Detección de ácidos nucleicos