Estudio sobre el método de análisis cuantitativo de ADN basado en chip de electroforesis en gel

LI Zhen-qing ,  

CHEN Qin ,  

ZHU Jian-dong ,  

ZENG Yuan ,  

ZHANG Da-wei ,  

Yamaguchi Yoshinori ,  

摘要

Para determinar la longitud y concentración del ADN en las bandas después de la electroforesis en gel, este artículo propone un método eficaz para analizar con precisión la longitud y concentración del ADN mediante la intensidad de fluorescencia del ADN. Se realizó electroforesis en gel con la escalera de ADN D2000, se capturaron y procesaron las imágenes. El análisis de datos utilizó la relación lineal entre la intensidad de fluorescencia y la concentración de ADN, así como la relación lineal entre la distancia de migración y la longitud del ADN. Los resultados mostraron que: al usar SYBR Green I como colorante fluorescente para la electroforesis del ADN, los valores de gris verde y rojo en cada píxel de la imagen pueden reflejar la información característica del ADN, y el valor de gris verde es claramente superior al valor de gris rojo; para fragmentos de ADN menores de 2 000 pares de bases, su peso molecular tiene una relación inversa con la distancia de migración, y cuando ambos toman logaritmos, el coeficiente de correlación alcanza 0,971, lo que puede usarse para establecer un modelo matemático para calcular el peso molecular del ADN según la distancia de migración; mediante el cálculo del valor máximo del pico de electroforesis y el área de integración del pico, se encontró que para dos bandas de ADN con una proporción de concentración de 2∶1, las proporciones fueron 2.16 y 1.96, 2.11 y 1.94, 2.16 y 1.93, lo que indica que el área de integración del pico de electroforesis puede reflejar más efectivamente el valor real de la concentración de ADN. Este estudio tiene un importante valor aplicado en el desarrollo de instrumentos de electroforesis en gel de ácidos nucleicos.

关键词

ácidos nucleicos; electroforesis en gel; análisis cuantitativo; biochip

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