В статье применяются компьютерное моделирование и спектроскопия для изучения взаимодействия между крезолом и лаклазой. Во-первых, компьютерное моделирование показало, что лаклаза может взаимодействовать с тремя изомерами крезола, результаты молекулярного докинга показывают, что лаклаза и изомеры крезола связываются посредством водородных связей и гидрофобных взаимодействий, при этом сайты связывания схожи. Сравнение различий в подвижности остатков лаклазы до и после связывания с крезолом с помощью молекулярной динамики подтвердило достоверность сайтов связывания, выявленных в молекулярном докинге. Во-вторых, выбран мета-крезол с хорошими результатами моделирования для исследования механизма флуоресцентного захвата и изменений вторичной структуры лаклазы до и после связывания с помощью спектроскопии. Эксперимент по флуоресцентному захвату подтвердил, что между лаклазой и мета-крезолом образуется статический бесфлуоресцентный комплекс, что соответствует результатам молекулярного докинга. Результаты инфракрасной спектроскопии показали, что после связывания с мета-крезолом происходит изменение вторичной структуры лаклазы: β-углы и антипараллельная β-структура преобразуются в β-слои, случайные завитки и α-спирали, что подтверждается результатами молекулярной динамики. Данное исследование предоставляет теоретическую основу и экспериментальные данные для использования лаклазы в трансформации загрязнителей крезола в окружающей среде.

лаклаза; мета-крезол; компьютерное моделирование; спектроскопия; взаимодействие