Исследование различия источника семян клещевины на основе интеграции энергетических признаков, машинного обучения и количественного анализа высокообиличных метаболитов

YUAN Meng-tao ,  

ZHANG Yuan-yuan ,  

HOU Chang ,  

HUANG Xuan ,  

YOU Wei ,  

CHEN Jia ,  

TAN Mei-lian ,  

GUO Lei ,  

LI Kai-kai ,  

XIE Jian-wei ,  

摘要

В экстренном реагировании на инциденты общественной безопасности, связанные с рицином, существует острая потребность в проведении классификации и прослеживании географического происхождения семян клещевины. В исследовании разработан метод анализа жирных кислот в семенах клещевины на основе газовой хроматографии–масс-спектрометрии и метод количественного определения рицина с помощью иммуноферментного анализа. Было проведено количественное измерение шести жирных кислот и рицина в 100 партиях образцов из 23 различных провинций Китая. Руководствуясь характеристиками энергетического метаболизма растений, введены 3 энергетических параметра (индекс ненасыщенности, отношение содержания олеиновой и линолевой кислот, соотношение содержания рицина и жирных кислот), которые эффективно интегрированы с тремя алгоритмами машинного обучения для определения происхождения. Оценка модели показала, что модель опорных векторов с L1-регуляризацией после введения энергетических параметров и при определении минимального набора признаков имеет площадь под ROC-кривой 73.63% и 71.95% соответственно, точность тестирования 70.37% и 68.52%, а точность на внешней валидации — 75.00%, что демонстрирует хорошую обобщающую способность. Исследование подтвердило потенциал применения высокообиличных метаболитов для прослеживания семян клещевины, а также показало, что внедрение энергетических параметров позволяет применить методы машинного обучения для биологически ориентированного анализа данных.

关键词

семена клещевины; рицин; жирные кислоты; географическое происхождение; машинное обучение; параметры энергетических признаков

阅读全文

以上内容由讯飞翻译自动生成,翻译内容仅供参考。对于因使用本网站翻译内容产生的相关后果,本网站不承担任何商业和法律责任。

The above content is generated by Large Model Translation. The translated content is for reference only. We do not assume any commercial or legal responsibilty for any consequences arising from the use of our website