Гетерогенность между клетками была доказана у различных организмов и в ходе их развития. Традиционные измерения в популяции клеток, основанные на средних показателях, часто не подходят для анализа клеточной гетерогенности, поэтому исследования на уровне отдельных клеток имеют решающее значение для понимания физиологического состояния каждой клетки. Белки являются основными носителями жизнедеятельности, поэтому анализ протеомики на уровне одной клетки особенно важен для точного изучения взаимосвязи сигнальных молекул и соответствующих сигнальных путей. Обычные методы, такие как иммунофлуоресценция, ограничены специфичностью связывания и доступностью антител, а также позволяют анализировать только предварительно выбранные белки. В данной статье представлен обзор распространённых в последние годы методов масс-спектрометрической протеомики отдельных клеток, которые в зависимости от стратегии анализа делятся на три подхода: снизу вверх, сверху вниз и натур-протеомика. Помимо описания методов исследования обсуждаются достижения в предварительной обработке белковых образцов. В заключение подводятся итоги, описываются проблемы и перспективы развития масс-спектрометрической протеомики отдельных клеток.