Разработан метод анализа распределения натриевых солей олигонуклеотидов с помощью матрично-ассистированной лазерной десорбции/ионизации с временем пролета масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS). Образцы одноцепочечных олигонуклеотидных праймеров (длина 20 п.н., теоретическая молекулярная масса 6 071,02 Да) были растворены в чистой воде и проанализированы методами высокоэффективной жидкостной хроматографии с масс-спектрометрией (HPLC-MS) и MALDI-TOF MS; далее образцы обрабатывались ацетатом натрия с последующим осаждением спиртом и повторным растворением, после чего вновь анализировались HPLC-MS и MALDI-TOF MS в режиме положительных ионов. До и после добавления натрия, после деконволюции, HPLC-MS показывал только один компонент без солей (соответствующая молекулярная масса 6 069,9 Да и 6 069,8 Да); MALDI-TOF MS для образцов без соли выявлял один компонент (молекулярная масса 6 071,09 Да), тогда как для образцов после добавления натрия наблюдалось распределение компонентов с различным числом ионов натрия: составляющие начинались с молекулы без натрия (около 6 071 Да), содержание росло, а затем снижалось, число добавленных ионов натрия варьировало от 0-4 до 0-19 в зависимости от условий добавления соли. Эти результаты показывают способность MALDI-TOF MS определять распределение солей натрия олигонуклеотидов, а также широкую адаптивность и чувствительность к различным степеням солесложения. На примере антисмыслового олигонуклеотидного препарата фамивирсена натрия проведён анализ чистого препарата и модельного животного инъекционного раствора с полиэтиленгликолем и твином с помощью MALDI-TOF MS. Результаты показали, что основная форма при солесложении содержала от 0 до 3 ионов натрия с постепенным снижением содержания и без изменений при добавлении матрицы; погрешность состава препарата составляла ±0,5 Да с высокой точностью, не влияющейся матрицей. Кроме того, несколько других компонентов матрицы (включая полиэтиленгликоль 300 и твин-80) отображались как отдельные пики на спектре без вмешательства в сигналы фамивирсена. Метод прост, быстр, чувствителен, подходит для качественной идентификации распределения натриевых солей олигонуклеотидов и не зависит от матрицы препаратов при анализе, что имеет важное значение для разработки и контроля качества антисмысловых олигонуклеотидных (ASO) препаратов.

MALDI-TOF MS;Олигонуклеотиды;Распределение натриевых солей олигонуклеотидов;Качественный анализ