분자 시뮬레이션과 분광학을 이용한 라카제와 크레졸 상호작용 분석

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摘要

본 논문은 컴퓨터 시뮬레이션과 분광학을 이용하여 크레졸과 라카제의 상호작용을 연구하였다. 먼저, 컴퓨터 시뮬레이션 결과 라카제는 세 가지 크레졸 이성질체와 상호작용할 수 있음을 보였다. 분자 도킹 연구 결과 라카제와 크레졸 이성질체는 수소 결합과 소수성 상호작용을 통해 결합하며, 결합 부위가 유사함을 나타냈다. 분자 동역학 시뮬레이션을 통해 라카제의 잔기 유연성이 크레졸 결합 전후에 어떻게 다른지 비교하여 분자 도킹 결합 부위의 신뢰성을 검증하였다. 둘째, 시뮬레이션에서 좋은 결과를 보인 메타크레졸을 선택하여 분광학을 이용해 메타크레졸과 라카제 간 형광 소광 기작 및 결합 전후 라카제의 2차 구조 변화를 조사하였다. 형광 소광 실험은 라카제와 메타크레졸 간에 형광이 없는 정적 소광 복합체가 형성된다는 것을 확인했으며, 이는 분자 도킹 결과와 일치한다. 적외선 분광 결과 라카제가 메타크레졸과 결합한 후 2차 구조가 변화했음을 보여주었으며, 내부 β-꺾임과 베타 반평행 구조가 베타 시트, 무질서 코일 및 알파 나선 구조로 전환되었는데, 이는 분자 동역학 시뮬레이션 결과와 일치한다. 이 연구는 환경 내 크레졸 오염물 전환을 위한 라카제 활용의 이론적 기반과 데이터 지원을 제공한다.

关键词

라카제; 메타크레졸; 컴퓨터 시뮬레이션; 분광학; 상호작용

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