종양 세포 mRNA 내 12종 정상 뉴클레오시드 및 변형 뉴클레오시드 분석법을 확립하였다. 종양 세포 샘플에서 총 RNA를 추출하고 mRNA를 정제한 후 mRNA를 가수분해하고, 내부 표준물질로 8-브로모구아노신(8Br-G)을 첨가하였다. 0.1% 포름산 수용액과 0.1% 포름산 메탄올 용액을 이동상으로 사용하여 Agilent RRHD SB-C18(2.1 mm×50 mm, 1.8 μm) 컬럼에서 분리하고, 양이온 스캔 전기분무 이온화원(ESI+) 및 다중 반응 모니터링(MRM) 모드로 검출하였다. 이 방법은 방법학적 검증 요구 사항을 충족하며, 12종 정상 뉴클레오시드 및 변형 뉴클레오시드는 일정 농도 범위 내에서 우수한 직선성을 보였고 상관계수(r)는 모두 0.99 이상이었다. 정량한계(LOQ)는 0.17~3.13 ng/mL, 검출한계(LOD)는 0.08~1.56 ng/mL였다. 확립된 방법을 인비인두암 5-8F 세포주, 자궁경부암 Hela 세포주 및 인배아 신장 상피 293T 세포주에 적용하여 다양한 변형 뉴클레오시드 수준을 성공적으로 검출하였다. 이 방법은 적은 세포 수(샘플당 2×10^6개), 짧은 분석 시간(샘플당 6분), 높은 감도를 가지며 암 연구 및 임상 진단에 효과적인 분석법을 제공한다.

뉴클레오시드; 변형 뉴클레오시드; mRNA; 종양 세포; 초고성능 액체 크로마토그래피-탠덤 질량 분석법(UPLC-MS/MS)