단일 세포 전사체 시퀀싱(scRNA-seq)은 세포 이질성을 전례 없는 해상도로 묘사할 수 있으나, 전통적인 scRNA-seq 방법은 높은 세포 손실률, 다중 세포(Doublets) 오염 및 높은 비용이라는 한계가 있습니다. 이러한 한계를 해결하기 위해 본 논문에서는 Well-Multi-seq 방법을 개발하였습니다. 크기 배제와 준정적 유체 포획이 결합된 중첩 마이크로포어 칩과 콜레스테롤 수정 올리고뉴클레오타이드 라벨링 전략을 통해 높은 세포 포획 효율, 낮은 오염 및 저비용의 다중 시료 혼합 단일 세포 전사체 시퀀싱을 실현하였습니다. 중첩 마이크로포어 칩을 이용하여 푸아송 분포의 제한을 극복하였고, 미구슬 점유율 94%, 세포 점유율 74%, 세포 포획률 87%를 달성하여 세포 및 마이크로챔버 활용도를 크게 향상시켰습니다. 콜레스테롤 분자의 안정적인 세포막 삽입 특성을 활용하여 시료 인코딩 올리고뉴클레오타이드 사슬을 세포 표면에 고정함으로써 다중 시료 단일 관 혼합 시퀀싱을 구현하였습니다. 이 전략은 시약 비용을 크게 절감하고 실험 과정을 간소화할 뿐만 아니라 라이브러리 내 다중 세포 오염을 식별하고 제거하는 기능을 제공합니다. 인간 및 마우스 세포주 혼합 시퀀싱에서 이 방법의 시료 표지 정확도는 각각 92.60%(인간)와 95.28%(마우스)에 달하여 우수한 표지 특이성을 입증하였습니다. Well-Multi-seq의 다중 장점을 기반으로 이 방법은 순환 종양 세포, 미세침 생검 샘플과 같은 희귀 세포 유형 및 약물 선별, 배아 발달과 같은 동적 과정 분석에 잠재적 응용 가치를 지니며, 기초 연구 및 임상 진단의 강력한 도구가 될 것으로 기대됩니다.

단일 세포 시퀀싱;마이크로플루이딕 칩;시료 다중 표지;콜레스테롤 수정 라벨