초고성능 액체 크로마토그래피-탠덤 질량분석법(UPLC-MS/MS)을 이용하여 사이클로포스파미드에 의해 유도된 면역저하 쥐 혈청 내 5가지 내인성 대사물질인 글루타티온(GSH), DL-글루타민(DL-Gln), 글루탐산(GA), 1-O-헥사데실-SN-글리세로-3-포스포콜린(LPC(0-16∶0)), 아라키돈산(AA)의 측정 방법을 확립하였다. 혈청 시료 단백질 침전 후, ACQUITY Poroshell 120 SB-C18 컬럼(2.1 mm×100 mm, 2.7 µm)과 5 mmol·L-1 아세트산 암모늄 수용액-메탄올 이동상을 사용하여 GSH, DL-Gln, GA, AA를 그라디언트 용출법으로 측정하였다. LPC(0-16∶0)는 ACQUITY UPLC BEH Amide 컬럼(2.1 mm×150 mm, 1.7 µm)과 5 mmol·L-1 포름산 암모늄 수용액-아세토니트릴 이동상을 사용한 그라디언트 용출법으로 측정하였다. 질량분석은 전자분무 이온원(ESI)의 양·음이온 모드 및 내부 표준법으로 정량하였다. 결과는 5가지 대사물이 각각 해당 농도 범위 내에서 좋은 직선성(r > 0.995)을 보였으며, 검출 한계는 0.043~0.178 ng·mL-1, 정량 한계는 0.145~0.592 ng·mL-1였다. 이 방법은 간단하고 빠르며 감도가 높아 쥐 혈청 내 내인성 대사물 측정에 적합하며 면역 저하 치료 약물의 작용 기전 연구에 실험적 기초를 제공한다.