인간화 단클론 항체는 상보성 결정 영역(CDR)를 이식하여 제작되며, 안전성과 효과 덕분에 치료용 항체 개발에 널리 활용됩니다. 정확한 경쇄 및 중쇄 CDR 서열 확보는 재조합 항체 생산의 핵심입니다. 본 연구는 통합 다중 효소 그라디언트 소화법과 상향식 질량분석 전략을 기반으로 3종의 인간화 범코로나바이러스 중화 항체(3D11, C1520, 5A6)를 de novo 시퀀싱하였고, 3가지 서로 다른 조립 알고리즘(PEAKS AB, Stitch, Fusion)을 이용해 항체 서열을 재구성하며 이들 알고리즘의 성능(조립 커버리지 및 정확도)을 체계적으로 비교했습니다. 결과에 따르면 현재 실험 조건 하에서 Fusion 알고리즘은 3종 항체 모두에서 경쇄 및 중쇄 100% 커버리지와 정확도를 달성하였으며, CDR 고변이 영역에서도 안정적이며 추가 서열 삽입이 없었습니다. 반면 PEAKS AB와 Stitch는 일부 영역에서 단편 누락, 삽입 또는 잘못된 조립이 있었습니다. 요약하면, Fusion 알고리즘이 보여준 견고성은 범코로나바이러스 중화 항체의 합리적 설계와 개발에 신뢰할 수 있는 서열 분석 기반을 제공합니다.

상향식 질량분석법;de novo 시퀀싱;서열 조립 알고리즘;범코로나바이러스;중화 항체