휴먼라이즈드 단클론 항체는 상보적 결정 부위(CDR)를 이식하여 구성되며, 그 안전성과 효능으로 인해 치료용 항체 개발에 널리 사용되고 있습니다. 정확한 경쇄 및 중쇄 CDR 서열 확보는 재조합 항체 생산의 핵심입니다. 본 연구는 통합 다중 효소 그라디언트 소화법과 보텀업 질량분석 기법을 기반으로 3종의 휴먼라이즈드 범코로나바이러스 중화 항체(3D11, C1520, 5A6)의 디노보(De novo) 서열 분석을 수행하였으며, 세 가지 서로 다른 조립 알고리즘(PEAKS AB, Stitch, Fusion)을 이용해 항체 서열을 재구성하고 이들 알고리즘의 성능(조립 범위 및 정확도)을 체계적으로 비교하였습니다. 결과에 따르면, 현 실험 조건 하에서 Fusion 알고리즘은 세 항체 모두에서 경쇄 및 중쇄에 대해 100% 조립 범위와 정확도를 달성하였으며, CDR 고변이 영역에서도 안정적이며 추가 서열 삽입이 없었습니다. 반면 PEAKS AB와 Stitch는 일부 영역에서 단편 누락, 삽입 또는 잘못된 조립이 관찰되었습니다. 종합적으로 Fusion 알고리즘의 견고성은 범코로나바이러스 중화 항체의 합리적 설계 및 개발을 위한 신뢰할 수 있는 서열 분석 기반을 제공합니다.

보텀업 질량분석법;디노보 서열분석;서열 조립 알고리즘;범코로나바이러스;중화 항체