기질 보조 레이저 탈착 이온화 비행시간 질량분석법(MALDI-TOF MS)을 이용한 올리고뉴클레오타이드 나트륨염 분포 분석 방법을 확립하였다. 단일 가닥 올리고뉴클레오타이드 프라이머 샘플(길이 20 bp, 이론 분자량 6,071.02 Da)을 순수한 물에 용해한 후 고성능 액체 크로마토그래피-질량분석기(HPLC-MS)와 MALDI-TOF MS로 검사하였다; 시료 용액은 아세트산 나트륨을 첨가하고, 알코올 침전 및 재용해 후 다시 HPLC-MS와 MALDI-TOF MS로 검사하였으며, 검사 모드는 모두 양이온 모드였다. 나트륨 첨가 전후로 HPLC-MS는 디콘볼루션 후에도 염을 첨가하지 않은 단일 성분만을 보여주었으며(분자량 각각 6,069.9 Da와 6,069.8 Da), MALDI-TOF MS는 첨가 전 시료에서 단일 성분(분자량 6,071.09 Da)을 나타냈으나, 첨가 후 시료에서는 서로 다른 나트륨 첨가 수의 분자들로 구성된 성분 분포를 보여주었다: 각 성분은 나트륨이 첨가되지 않은 분자(분자량 약 6,071 Da)부터 시작하였으며, 함량은 처음 증가하다가 감소하는 경향을 보였고, 나트륨 첨가 수는 0~4에서 0~19까지 다양하였으며, 분포는 염 첨가 조건에 따라 달라졌다. 이러한 결과는 MALDI-TOF MS가 올리고뉴클레오타이드 나트륨염 성분 분포를 감지할 수 있음을 보여주며, 또한 다양한 염 첨가 정도를 가진 올리고뉴클레오타이드 분자의 넓은 적응성 및 민감도를 지닌다. 반의 올리고뉴클레오타이드 약물인 포미비르센 나트륨을 시료로 사용하여, MALDI-TOF MS를 이용해 순수한 포미비르센 나트륨과 폴리에틸렌 글리콜 및 트윈 등이 함유된 포미비르센 나트륨 동물 주사액 모델을 각각 검사하였다. 결과는 포미비르센 나트륨의 주요 나트륨 첨가 형태가 0개에서 3개까지이며 전반적인 함량은 감소하는 추세를 보였고, 기질 첨가 전후에 변화가 없었으며; 또한 포미비르센 나트륨 성분의 오차도 ±0.5 Da 범위 내에 있어 정확도가 기질의 영향 없이 유지되었음을 나타냈다. 더불어 기질 내 다른 여러 성분(폴리에틸렌 글리콜 300 및 트윈-80 포함)도 질량 스펙트럼에서 독립적으로 나타나 포미비르센 나트륨 성분에 방해가 되지 않았다. 이 방법은 간단하고 빠르며 민감도가 높아, 다양한 올리고뉴클레오타이드 나트륨염 분포의 정성적 확인에 적합하며, 실제 약물 검사 시 약물 기질의 영향도 받지 않아 반의 올리고뉴클레오타이드(ASO) 약물의 개발 및 검사에 중요한 의의를 가진다.

MALDI-TOF MS;올리고뉴클레오타이드;올리고뉴클레오타이드 나트륨염 분포;정성 분석