超高速液体クロマトグラフィータンデム質量分析法による腫瘍細胞mRNA中の12種類の正常ヌクレオシド及び修飾ヌクレオシドの同時測定(英文)

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摘要

腫瘍細胞mRNA中の12種類の正常ヌクレオシドおよび修飾ヌクレオシドの分析法を確立した。腫瘍細胞サンプルから総RNAを抽出し、mRNAを精製して加水分解後に、8-ブロモグアノシン(8Br-G)を内部標準として添加した。0.1%蟻酸水溶液および0.1%蟻酸メタノール溶液を移動相として使用し、Agilent RRHD SB-C18(2.1 mm×50 mm,1.8 μm)カラムで分離、エレクトロスプレーイオン化源陽イオンモード(ESI+)、多重反応モニタリング(MRM)モードで検出した。本法は方法論的検証の要件を満たし、12種類の正常及び修飾ヌクレオシドは一定の濃度範囲内で良好な直線性を示し、相関係数 (r) はすべて0.99以上であった。定量下限(LOQ)は0.17~3.13 ng/mL、検出限(LOD)は0.08~1.56 ng/mLであった。確立した方法をヒト鼻咽頭癌5-8F細胞株、ヒト子宮頸癌Hela細胞株及びヒト胚腎上皮293T細胞株に適用し、複数の修飾ヌクレオシドレベルの検出に成功した。本法はセル数が少なく(サンプルあたり2×10^6個)、分析時間が短く(サンプルあたり6分)、感度が高く、がん研究および臨床診断に有効な分析法を提供する。

关键词

ヌクレオシド; 修飾ヌクレオシド; mRNA; 腫瘍細胞; 超高速液体クロマトグラフィータンデム質量分析法(UPLC-MS/MS)

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