ホルマリン固定パラフィン包埋(Formalin-fixed and paraffin-embedding, FFPE)は、最も一般的な臨床組織保存技術である。FFPE組織は標準化された調製プロセス、保存のしやすさ、多量の標本、および比較的完全な臨床的追跡情報を特徴とし、疾患バイオマーカーの発掘に優れた媒体となっている。近年、臨床FFPE組織の特性に基づき、試料調製、消化、分離からタンパク質質量分析までを含む一連のプロテオミクス研究手法が開発されており、微量、高感度、高スループットという技術的特徴を示し、がんの精密医療などの臨床プロテオミクス研究に成功裏に応用されている。本総説は、FFPE組織切片サンプルのプロテオミクス手法およびがん研究における応用について概説し、臨床精密医療プロテオミクス研究の参考となることを目的とする。

ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE); 臨床プロテオミクス; 糖鎖付加; バイオマーカー