細胞間の異質性は、さまざまな生物体およびその発生過程に存在することが証明されています。従来の細胞集団における測定結果の平均値は、単一細胞の異質性の解析には往々にして適さないため、単一細胞レベルでの研究が個々の細胞の生理状態を理解する上で非常に重要です。タンパク質は生命活動の主要担い手であり、単一細胞プロテオミクス解析はシグナル分子と関連するシグナル経路との関係を正確に研究する上で重要な意義を持ちます。従来の免疫蛍光法などの技術は抗体の結合特異性および利用可能性によって制限されており、事前に選択されたタンパク質のみを分析対象としています。本稿では近年の質量分析に基づく単一細胞プロテオミクスで用いられる一般的な手法を、分析戦略によりボトムアップ法、トップダウン法およびナチュラルプロテオミクスの3つに分類し、研究手法の紹介とともにタンパク質サンプルの前処理の進展についても論じます。最後に、質量分析に基づく単一細胞プロテオミクス研究が直面する課題と展望についてまとめます。

質量分析（MS）；プロテオミクス；単一細胞；サンプル前処理