La fixation au formol et l’inclusion en paraffine (Formalin-fixed and paraffin-embedding, FFPE) est la technique de conservation des tissus cliniques la plus courante. Les tissus FFPE présentent un processus de préparation standardisé, une facilité de stockage, un grand nombre d’échantillons, ainsi qu’une information clinique rétrospective relativement complète, ce qui en fait un bon support pour la découverte de biomarqueurs de maladies. Ces dernières années, sur la base des caractéristiques cliniques des tissus FFPE, une série de méthodes de protéomique ont été développées, incluant la préparation des échantillons, la digestion, la séparation et l’identification des protéines par spectrométrie de masse, présentant globalement des caractéristiques de faible quantité, haute sensibilité et haut débit, et ont été utilisées avec succès dans les études cliniques de protéomique en médecine de précision oncologique. Cette revue donne un aperçu des méthodes protéomiques des coupes de tissus FFPE, ainsi que de leurs applications dans la recherche sur le cancer, fournissant ainsi des idées de référence pour la recherche protéomique en médecine de précision clinique.

Fixation au formol et inclusion en paraffine (FFPE); protéomique clinique; réticulation; biomarqueurs