La diversité topologique des quadruplex G (G4) est étroitement liée à leurs fonctions biologiques, et l’établissement de méthodes de détection à haute sensibilité est crucial pour élucider la relation structure-fonction. Cette étude évalue systématiquement les performances de détection des G4 par trois nanopores : la porine MspA de Mycobacterium smegmatis, l’aérolysine (AeL) et l’alpha-hémolysine (HL). Un système de détection nanoporique mono-moléculaire sans marquage centré sur HL a été construit avec succès. Ce système permet de distinguer efficacement l’ADN simple brin (ssAf17) des G4 avec différentes topologies, telles que la structure parallèle c-Myc, la structure antiparallèle TBA et la structure mixte H24A. Pour résoudre le problème du temps de blocage trop long du c-Myc27bp, une structure c-Myc77bp a été conçue en ajoutant 25 adénines (A) aux deux extrémités de la séquence. Cette structure présente un signal caractéristique en "double palier" lors du passage à travers le pore, améliorant significativement la reconnaissance du signal et l’efficacité de passage. Cette étude propose une nouvelle stratégie pour l’analyse mono-moléculaire des topologies G4, étendant l’application de la technologie des nanopores à l’analyse des structures secondaires des acides nucléiques et offrant un soutien technique au développement de médicaments ciblant des maladies associées.

technologie des nanopores; quadruplex G; détection mono-moléculaire; distinction topologique; alpha-hémolysine