Méthode de détection d'Edwardsiella tarda par amplification en boucle associée à des bandelettes chromatographiques marquées par des microbilles de latex

WU Jing-ying ,  

FENG Jian-jun ,  

WANG Yi-lei ,  

GUO Song-lin ,  

LIN Peng ,  

摘要

Edwardsiella tarda lent (Edwardsiella tarda) est une bactérie pathogène importante dans l'aquaculture. Des méthodes rapides, efficaces et adaptées à la détection sur site peuvent prévenir et contrôler efficacement l'apparition des maladies. Cet article combine l'amplification par cercle roulant (RCA) avec la technique des bandelettes chromatographiques (LFS) en utilisant des microbilles de latex comme marqueurs pour établir une nouvelle méthode RCA-LFS de détection d'Edwardsiella tarda. Des sondes verrouillées et des amorces d'amplification ont été conçues en fonction du gène gyrb de cette bactérie. Les conditions optimisées pour la RCA sont les suivantes : concentration de la sonde verrouillée à 500 pmol/L, température d'amplification à 61 ℃, temps d'amplification de 50 min. Après amplification, la bandelette chromatographique est directement insérée dans la solution du produit d'amplification et les résultats sont lus à l'œil nu. Cette méthode présente une grande spécificité, sans réaction croisée avec d'autres pathogènes courants, avec une limite de détection de l'ADN génomique d'Edwardsiella tarda de 50 ng/mL. Comparées aux marqueurs d'or colloïdal courants, les microbilles de latex sont stables et offrent une plus grande variété de couleurs, et pourraient permettre une détection simultanée de multiples bactéries uniquement par changement de couleur. La méthode RCA-LFS a été utilisée pour détecter des échantillons infectés d'anguille japonaise, avec des résultats cohérents avec ceux obtenus par électrophorèse sur gel classique, tout en étant plus simple, rapide et plus facile à interpréter. La méthode RCA-LFS joue un rôle significatif dans la détection sur site des agents pathogènes.

关键词

amplification en boucle;Edwardsiella tarda lent;sonde verrouillée;microbilles de latex;bandelettes chromatographiques

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