Die Formalin-Fixierung und Paraffin-Einbettung (Formalin-fixed and paraffin-embedding, FFPE) ist die am häufigsten verwendete Methode zur klinischen Gewebeaufbewahrung. FFPE-Gewebe zeichnen sich durch standardisierte Herstellungsprozesse, einfache Lagerung, große Probenmengen und relativ vollständige klinische retrospektive Informationen aus, wodurch sie zu einem guten Träger für die Entdeckung von Krankheitsbiomarkern werden. In den letzten Jahren wurden auf Basis der Eigenschaften klinischer FFPE-Gewebe eine Reihe von proteomischen Forschungsmethoden entwickelt, einschließlich Probenvorbereitung, Verdau, Trennung bis hin zur Proteindetektion mittels Massenspektrometrie; insgesamt weisen sie Merkmale wie geringe Probenmengen, hohe Empfindlichkeit und hohe Durchsatzraten auf und wurden bereits erfolgreich in klinischen proteomischen Studien der Tumorpräzisionsmedizin eingesetzt. Diese Übersichtsarbeit gibt einen Überblick über proteomische Methoden für FFPE-Gewebeschnittproben und deren Anwendung in der Tumorforschung, um als Referenz für proteomische Forschung in der klinischen Präzisionsmedizin zu dienen.

Formalin-Fixierung und Paraffin-Einbettung (FFPE); klinische Proteomik; Vernetzung; Biomarker