Entwicklung und Anwendung der lösungsmittelinduzierten Proteinpräzipitationsmethode zur Identifikation von Ligand-Zielproteinen

ZHANG Xiao-lei ,  

YE Yu-ying ,  

YE Ming-liang ,  

摘要

Medikamente regulieren lebenswichtige Aktivitäten durch Bindung an Zielproteine. Die Analyse von Wechselwirkungen zwischen Medikamenten und Proteinen ist der Schlüssel zur Aufklärung von Wirkmechanismen, zur Verringerung toxischer Nebenwirkungen, zur Überwindung von Resistenzen und zur Förderung der Wirkstoffentwicklung. Traditionelle Methodiken zur Zielidentifikation erfordern häufig chemische Modifikationen der Medikamente, die die natürliche Bindung stören und zu falsch-positiven Ergebnissen führen können. Die Lösungsmittel-induzierte Proteinpräzipitationsmethode (SIP) benötigt keine chemischen Modifikationen und realisiert einen Hochdurchsatz-Screening von Zielproteinen durch Erkennung von Stabilitätsänderungen der Proteine infolge der Ligandenbindung, mit Vorteilen wie einfacher Handhabung und hoher Anwendbarkeit. In den letzten Jahren entwickelten Forscher auf SIP basierende Derivate wie die lösungsmittelbasierte Proteomanalyse (SPP), integrierte lösungsmittelinduziert Proteinlöslichkeit Veränderung (solvent-PISA), integrierte lösungsmittelinduzierte Proteinpräzipitationsmethode (iSPP) sowie die lebende Zellen teilweise lösungsmittel-induzierte Fixierungsmethode (SICFA), die die Durchsatzrate und Systemanpassung signifikant verbesserten. Diese Arbeit gibt einen systematischen Überblick über die grundlegenden Prinzipien, technologische Entwicklungen sowie Vor- und Nachteile von SIP und fasst Anwendungen in der Zielerkennung und Validierung in den Bereichen Krebs, Parkinson, antimikrobielle Resistenz und Malaria zusammen, und bietet Referenzen für präzise Zielidentifikation und innovative Medikamentenentwicklung.

关键词

Zielidentifikation;chemisch unveränderte Liganden;Proteomik;Flüssigchromatographie-Massenspektrometrie

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