Untersuchung der quantitativen DNA-Analysemethode basierend auf einem Gelelektrophoresechip

LI Zhen-qing ,  

CHEN Qin ,  

ZHU Jian-dong ,  

ZENG Yuan ,  

ZHANG Da-wei ,  

Yamaguchi Yoshinori ,  

摘要

Zur Bestimmung der Länge und Konzentration der DNA in den Banden nach der Gelelektrophorese schlägt dieser Artikel eine effektive Methode zur genauen Analyse der DNA-Länge und -Konzentration basierend auf der DNA-Fluoreszenzintensität vor. Es wurde eine Gelelektrophorese der D2000 DNA-Leiter durchgeführt, Bilder wurden aufgenommen und verarbeitet. Für die Datenanalyse wurden die lineare Beziehung zwischen Fluoreszenzintensität und DNA-Konzentration sowie die lineare Beziehung zwischen Wanderungsdistanz und DNA-Länge genutzt. Die Ergebnisse zeigten: Bei Verwendung von SYBR Green I als Fluoreszenzfarbstoff für die DNA-Elektrophorese können die grünen und roten Graustufenwerte in jedem Bildpixel die DNA-Eigenschaften widerspiegeln, wobei die grünen Graustufenwerte deutlich höher als die roten sind; für DNA-Fragmente unter 2000 bp besteht eine umgekehrte Verhältnisfunktion zwischen Molekulargewicht und Wanderungsdistanz, und beim Logarithmieren beider Werte beträgt der Korrelationskoeffizient 0,971, was die Erstellung eines mathematischen Modells zur Berechnung des Molekulargewichts basierend auf der Wanderungsdistanz ermöglicht; durch Berechnung der Elektrophorese-Peakwerte und der Integrationsfläche der Peaks wurde festgestellt, dass die Verhältnisse zweier DNA-Banden mit einer Konzentrationsrate von 2∶1 bei 2,16 und 1,96, 2,11 und 1,94 sowie 2,16 und 1,93 lagen, was darauf hinweist, dass die Integrationsfläche des Elektrophorese-Peaks die tatsächliche DNA-Konzentration effektiver widerspiegeln kann. Diese Studie hat eine wichtige Anwendungsbedeutung für die Entwicklung von Nukleinsäure-Gelelektrophoresegeräten.

关键词

Nukleinsäuren; Gelelektrophorese; quantitative Analyse; Biochip

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