تقييم خوارزميات تجميع تسلسل الأجسام المضادة من البداية وتطبيقها في تحليل الأجسام المضادة المعاد تأسيها ضد الفيروسات التاجية
摘要
تم بناء الأجسام المضادة أحادية النسيلة المؤنسنة من خلال زرع مناطق تحديد التكامل التكميلية (CDRs)، ونظرًا لأمانها وفعاليتها، فهي تُستخدم على نطاق واسع في تطوير الأجسام المضادة العلاجية. إن الحصول على تسلسل دقيق لسلاسل الخفيفة والثقيلة من CDR هو مفتاح إنتاج الأجسام المضادة المعاد تركيبها. استندت هذه الدراسة إلى طريقة تحلل متعدد الإنزيمات المتدرجة المتكاملة واستراتيجية الطيف الكتلي التصاعدي، حيث أجرت تواليًا مبدئيًا لثلاثة أجسام مضادة معاد تأسية ضد الفيروسات التاجية البشرية (3D11، C1520، 5A6)، واستخدمت ثلاث خوارزميات تجميع مختلفة (PEAKS AB وStitch وFusion) لإعادة بناء تسلسل الأجسام المضادة، كما قورنت أداء هذه الخوارزميات الثلاث (تغطية التجميع والدقة) بشكل منهجي. أظهرت النتائج أنه تحت الظروف التجريبية الحالية، يمكن لخوارزمية Fusion تحقيق تغطية ودقة بنسبة 100٪ لكل من السلسلتين الخفيفة والثقيلة في الأجسام المضادة الثلاثة، مع ثبات في مناطق CDR شديدة التغير دون إدخالات متسلسلة إضافية. بالمقارنة، توجد نقص في القطع، إدخالات أو تجميع خاطئ في بعض المناطق لدى PEAKS AB وStitch. في الختام، تبرز المتانة التي أظهرتها خوارزمية Fusion كأساس تحليل تسلسل موثوق لتصميم وتطوير الأجسام المضادة المعاد تأسيها ضد الفيروسات التاجية.
关键词
الطيف الكتلي التصاعدي;التسلسل من البداية;خوارزميات تجميع التسلسل;الفيروسات التاجية;الأجسام المضادة المعاد تأسيها
以上内容由讯飞翻译自动生成，翻译内容仅供参考。对于因使用本网站翻译内容产生的相关后果，本网站不承担任何商业和法律责任。
The above content is generated by Large Model Translation. The translated content is for reference only. We do not assume any commercial or legal responsibilty for any consequences arising from the use of our website