تم تطوير طريقة لتحليل توزيع أملاح الصوديوم لأوليجنوكليوتيدات باستخدام مطياف الكتلة بزمن الطيران مع تأين الليزر بمساعدة المصفوفة (MALDI-TOF MS). تم فحص عينات البادئات لأوليجنوكليوتيدات أحادية الخيط (بطول 20 قاعدة زوجية، الوزن الجزيئي النظري 6,071.02 دالتون) بعد إذابتها في الماء النقي باستخدام الكروماتوغرافيا السائلة عالية الأداء-مطياف الكتلة (HPLC-MS) وMALDI-TOF MS. بعد معالجة العينة بإضافة أسيتات الصوديوم، ترسيب بالكحول وإعادة الذوبان، تم الفحص مرة أخرى باستخدام HPLC-MS وMALDI-TOF MS في وضع الأيونات الموجبة. أظهر HPLC-MS بعد فك التراكب وجود مكون واحد بدون إضافة ملح (بوزن جزيئي 6,069.9 دالتون و6,069.8 دالتون على التوالي) قبل وبعد إضافة الصوديوم؛ بينما أظهر MALDI-TOF MS عينة بدون ملح مكونًا واحدًا (بوزن جزيئي 6,071.09 دالتون) وعينة بعد الإضافة توزيع مكونات بأعداد مختلفة من الصوديوم المرتبط: تبدأ المكونات من جزيء بدون صوديوم (حوالي 6,071 دالتون) مع تباين في التركيز يزيد ثم ينخفض، وعدد الصوديوم المضاف يتراوح من 0-4 إلى 0-19 حسب ظروف إضافة الملح. تظهر النتائج قدرة MALDI-TOF MS على الكشف عن توزيع أملاح الصوديوم للoligonucleotides مع توافقية وحساسية عالية لأنواع مختلفة من الجزيئات. باستخدام دواء أوليجنوكليوتيد مضاد التوجيه فورميڤيسين الصوديوم كنموذج، تم تحليل الدواء النقي ونموذج حقن حيواني يحتوي على بولي إيثيلين جليكول والعديد من المواد المساعدة باستخدام MALDI-TOF MS. أظهرت النتائج أن الشكل الرئيسي المضاف إليه الصوديوم كان من 0 إلى 3 ذرات صوديوم، مع تميل تركيزه للنقصان، ولم تتغير قبل وبعد إضافة المصفوفة؛ وانحراف مكونات الدواء كان ضمن ±0.5 دالتون، مما يدل على دقة ثابتة غير متأثرة بالمصفوفة. بالإضافة إلى ذلك، أظهرت مكونات أخرى في المصفوفة (بما في ذلك بولي إيثيلين جليكول 300 وتويت-80) إشارات واضحة مستقلة لا تتداخل مع مكونات الفورميڤيسين. الطريقة بسيطة وسريعة وحساسة، مناسبة للتحليل النوعي لتوزيع أملاح الصوديوم لأوليجنوكليوتيدات، وغير متأثرة بمصفوفة الأدوية عند الفحص العملي، ولها أهمية كبيرة لتطوير وفحص أدوية ASO.