应用反相高效液相色谱法测定了鲑鱼精子ＤＮＡ的碱基组成比例，并就有关分析条件进行了优化选择。结果表明：在相关条件中，ＤＮＡ样品的水解条件、标准碱基溶液和ＤＮＡ水解液的ｐＨ值、液相色谱流动相的组成和ｐＨ值是影响各碱基色谱峰分离和峰形以及排除杂质干扰的主要因素。在优化选择的条件下测定，各碱基色谱峰分离完全、峰形好且不受杂质干扰，ＤＮＡ样品中各碱基回收量高。当检测信号衰减８倍时，各碱基的最小检测量低于５ｎｇ。６次重复测定鱼精ＤＮＡ的（Ｇ＋Ｃ）ｍｏｌ％的标准偏差小于０．２５，变异系数小于０．６％，实测值与文献值相符。此法１次进样分析时间约７ｍｉｎ，亦可分析ＲＮＡ碱基组成。