基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析

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研究报告 | 更新时间：2025-02-21

- 基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析
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- 分析测试学报 2009年第2期页码：129-134
- 作者机构：
  
  1. 上海交通大学系统生物医学研究院
  2. 浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院
- 作者简介：
- 基金信息：
  
  上海市科委纳米专项基金资助项目(05dz22321)
- DOI：
  中图分类号： R737.31
- 纸质出版日期：2009
- 稿件说明：
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张政希, 莫凡, 郭妍, 徐学敏, 林标扬, 李伟. 基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析[J]. 分析测试学报, 2009,(2):129-134.
张政希, 莫凡, 郭妍, 徐学敏, 林标扬, 李伟. 基于illumina测序技术的IGROV-1/CP细胞中miRNA种类鉴定及相对丰度分析[J]. 分析测试学报, 2009,(2):129-134. DOI：

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从正常培养的IGROV-1/CP细胞中提取小RNA

构建小RNA的cDNA文库

然后用illum ina通用测序平台对上述cDNA文库进行测序。从测序获得的序列数据中去除冗余数据后

与已知人类m iRNA序列数据库进行比对

获得IGROV-1/CP细胞m iRNA表达谱。以所获的序列长度与已知人类m iRNA数据库中序列长度差异不大于2和无碱基错配为限制条件

共找到53种已知m iRNA。按在cDNA文库测序中的出现频率计算

出现频率不大于10的低拷贝m iRNA最多

占检测到所有m iRNA种类的56.6%。说明illum ina通用测序技术能够在检测细胞内的各种小RNA序列的同时反应相对丰度信息

该研究利用上述新技术获得了顺铂耐药性IGROV-1/CP细胞系m iRNA表达种类和相对丰度的实验数据。

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